Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BC061212Q6P8K3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BC061212Q6P8K3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms