Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podnl1Q6P3Y9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Podnl1Q6P3Y9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms