Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig8Q6P3A4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig8Q6P3A4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms