Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Best3Q6H1V1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Best3Q6H1V1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Best3Q6H1V1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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