Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep290Q6A078 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep290Q6A078 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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