Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpalpp1Q69ZC8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpalpp1Q69ZC8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpalpp1Q69ZC8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms