Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spty2d1Q68FG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spty2d1Q68FG3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spty2d1Q68FG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms