Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Surf4Q64310 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf4Q64310 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms