Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd33Q63994 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms