Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zpr1Q62384 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zpr1Q62384 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zpr1Q62384 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms