Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Six1Q62231 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Six1Q62231 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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