Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Siglec1Q62230 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Siglec1Q62230 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Siglec1Q62230 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Siglec1Q62230 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Siglec1Q62230 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms