Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sycp1Q62209 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms