Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4bQ62179 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4bQ62179 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms