Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a2Q62148 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms