Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn1Q61809 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrn1Q61809 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Lrrn1Q61809 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrn1Q61809 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn1Q61809 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Lrrn1Q61809 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 384.4 ms