Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hif1aQ61221 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hif1aQ61221 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hif1aQ61221 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms