Protein–RNA interactions for Protein: Q61097

Ksr1, Kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ksr1Q61097 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ksr1Q61097 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ksr1Q61097 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ksr1Q61097 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms