Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cep250Q60952 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep250Q60952 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms