Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mkrn3Q60764 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mkrn3Q60764 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mkrn3Q60764 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms