Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FshbQ60687 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FshbQ60687 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FshbQ60687 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FshbQ60687 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms