Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf123Q5XPI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf123Q5XPI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf123Q5XPI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms