Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scaf1Q5U4C3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scaf1Q5U4C3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf1Q5U4C3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms