Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brip1Q5SXJ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brip1Q5SXJ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brip1Q5SXJ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms