Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps54Q5SPW0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps54Q5SPW0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms