Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PkdccQ5RJI4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms