Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc47Q505F5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc47Q505F5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc47Q505F5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms