Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc3lQ4KL14 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc3lQ4KL14 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trappc3lQ4KL14 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms