Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al1nQ497L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms