Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clul1Q3ZRW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms