Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckap2Q3V1H1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap2Q3V1H1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms