Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd53Q3V0J4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd53Q3V0J4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd53Q3V0J4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ankrd53Q3V0J4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ankrd53Q3V0J4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ankrd53Q3V0J4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ankrd53Q3V0J4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms