Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9Q3V038 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms