Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc160Q3UYG1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms