Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CrxosQ3UL53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CrxosQ3UL53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms