Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3UJC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3UJC8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3UJC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UJC8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UJC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UJC8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UJC8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UJC8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UJC8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms