Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnep1r1Q3UJ81 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms