Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mcrip1Q3UGS4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mcrip1Q3UGS4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms