Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3j1Q3UGC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Eif3j1Q3UGC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eif3j1Q3UGC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277 ms