Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms