Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zyg11bQ3UFS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zyg11bQ3UFS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zyg11bQ3UFS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zyg11bQ3UFS0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zyg11bQ3UFS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zyg11bQ3UFS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms