Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Yipf3Q3UDR8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Yipf3Q3UDR8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms