Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc17a7Q3TXX4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc17a7Q3TXX4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms