Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd1Q3TXS7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd1Q3TXS7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms