Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1500011B03RikQ3TTH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1500011B03RikQ3TTH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms