Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Calr4Q3TQS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Calr4Q3TQS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Calr4Q3TQS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms