Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul4aQ3TCH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul4aQ3TCH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms