Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms