Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb38Q3LR78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zbtb38Q3LR78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb38Q3LR78 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms