Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdgfl1Q2VPR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms